อุบัติการณ์ทั้งหมดเริ่มจากเนตรเนตรนี้

คุโมะ อิวะ คิริ สึนะ นินจาปกป้องหมู่บ้านของทั้ง 4 แคว้นหายตัวไปอย่างลึกลับ จากนั้นภาพโฮโลแกรมขนาดใหญ่ได้ฉายขึ้นให้ได้เห็นกันทั่วทุกหมู่บ้าน ปรากฏเป็นภาพนินจาปริศนา ฮิรุโกะ พร้อมกับประกาศสงคราม

"เมื่อใดที่ได้ขีดจำกัดสายเลือดทั้ง 5 มาครอบครองฉันจะเป็นผู้คุมกฏในโลกใบนี้" ความตึงเครียดเริ่มทวีความรุนแรงเมื่อแต่ละแคว้นเริ่มสูญเสียนินจาของตนเอง ซึนาเดะ โฮคาเงะรุ่นที่ 5 จึงได้ประกาศใช้กฏอัยการศึก ในเวลานั้นเอง คาคาชิก ก็หายตัวออกไปจากหมู่บ้านอย่างไร้ร่องรอย